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EVENTO



Curso CBAB/CABBIO 2015 Ferramentas de bioinformática aplicadas às análises de sequências de RNA-Seq (27 de julho a 07 de agosto)

E-mail:
marisa@lncc.br

Tipo de evento:
Escola


ALUNOS BRASILEIROS SELECIONADOS COM CUSTEIO

Douglas Fabiano Gomes, Embrapa Soja
Elizabete de Souza Cândido, UCB
Leonardo Martins Silva, UNIFESP
Maria de Fátima dos Santos Sampaio, UENF
Renato Augusto Corrêa dos Santos, CNPEM/CTBE
Stela Mirla da Silva Felipe, UECE
Vinicius Augusto Carvalho de Abreu, CENA-USP
Wallax Augusto Silva Ferreira, UFPA

ALUNOS BRASILEIROS SELECIONADOS SEM CUSTEIO

Ana Paula Chiaverini Pinto, ESALQ/USP
André Luiz Molan, UNESP-Botucatu
Danilo Elias Xavier, Fiocruz CPQAM
Eliane Cardoso Carvalho, UFAM
Gabriel Rodrigues Cavalheiro, UFRJ
Helen Alves Penha, UNESP-FCAVJ
Juliana Alves Resende, UFJF
Karina Barbosa de QueirozCPqRR-Fiocruz,
Karina Freire d’Eça Nogueira Santos, UFPR
Luiz H da Silva Nali , USP
María José Carlini, ICESP
Mariane Brom Sobreiro, UFG
Marlon Henrique e Silva Cardoso, UNB
Omar Julio Sosa, USP
Patricia Dayane Carvalho Schaker, ESALQ/USP
Sávio Henrique de Cicco Sandes, UFMG
Simone Teixeira Bonecker dos Santos, INCA
Tulio de Lima Campos , Fiocruz CPQAM
Willames Marcos Brasileiro da Silva Martins, UNIFESP


As novas estratégias de sequenciamento de DNA de alto desempenho permitem o sequenciamento e análise de milhares de fragmentos de nucleotídeos em paralelo, gerando cada vez mais dados em menor tempo e custo. Com estas tecnologias de sequenciamento de alto desempenho, os projetos de genômica têm se tornado um grande desafio para as análises de bioinformática. Para isso, novas ferramentas foram desenvolvidas e bancos específicos foram criados para tratar especificamente das características intrínsecas desses projetos. Dessa forma, com a mudança de paradigma nas análises dos dados, novos algoritmos foram desenvolvidos para tratar, analisar e classificar as sequências geradas pelas novas plataformas de sequenciamento.

Podemos afirmar que a transcriptômica tem sido a abordagem que mais cresceu com o advento das estratégias de sequenciamento de DNA de alto desempenho. Atualmente, todas as plataformas comerciais de sequenciamento de alto desempenho podem sequenciar DNA complementar (cDNA) ao RNA mensageiro em larga escala. Essa abordagem, conhecida como RNA-seq, tem sido aplicada para o sequenciamento de transcritos, tanto de organismos procariotos quanto de eucariotos.
A presente proposta de curso CBAB 2015 consistirá no ensino das principais ferramentas de bioinformática para uso na análise de dados de RNA-seq. Serão ministradas aulas teóricas e aulas práticas em computadores.

AS INSCRIÇÕES PODEM SER EFETUADAS NO PERÍODO DE 12 DE MAIO À 12 DE JUNHO DE 2015

CARGA HORÁRIA: 80 h

TOTAL DE VAGAS: 30

REQUISITOS BÁSICOS PARA PARTICIPAR DO CURSO:


Nível de instrução acadêmica: pós-graduandos (mestrando e doutorando), pós-doutorandos ou pesquisadores;


Atuação profissional do candidato: Genética, Genômica, Biotecnologia, Bioinformática ou ares afins.

INSCRIÇÕES PARA CANDIDATOS BRASILEIROS:

A admissão de interessados em participar do curso é limitada e sujeita à seleção. Para que a inscrição seja aceita, é necessário:

* que o candidato preencha e submeta o formulário de inscrição (FORM A), juntamente com o link para o currículo da Plataforma Lattes;
* quando for o caso, que o candidato apresente o comprovante de matrícula no curso de pós-graduação, resumo do projeto de dissertação ou tese; E

* QUE O ORIENTADOR OU CHEFE DO GRUPO DE PESQUISA OU CHEFE IMEDIATO NA INSTITUIÇÃO DE VÍNCULO PREENCHA E ENVIE o formulário para recomendação (FORM B) DE SEU ENDEREÇO ELETRÔNICO INSTITUCIONAL OU DO CNPq (nomedopesquisador@pq.cnpq.br).

As inscrições devem ser encaminhadas para: marisa@lncc.br

LINK PARA FORMULÁRIOS A E B:
http://www.mct.gov.br/index.php/content/view/328350/Instrucoes_para_candidatos_brasileiros.html

INSCRIÇÕES PARA CANDIDATOS ESTRANGEIROS:

http://www.mct.gov.br/index.php/content/view/328347/Candidatos_argentinos_uruguaios_paraguaios_e_colombianos.html

A admissão de interessados em participar dos cursos CBAB/CABBIO é limitada e sujeita à seleção. Para que a inscrição seja aceita, é necessário:

* que o candidato preencha e submeta o formulário de inscrição (FORM A), juntamente com uma cópia atualizada do currículo; E
* que o orientador ou o chefe de grupo de pesquisa preencha e envie o formulário para recomendação (FORM B) de seu endereço eletrônico institucional.
* Quando for o caso, que o candidato apresente o comprovante de matrícula no curso de pós-graduação, resumo do projeto de dissertação ou tese.

As inscrições devem ser encaminhadas ao ponto focal do país de origem do candidato:

Argentina: MINCyT - cabbio@mincyt.gov.ar

Uruguai: DICyT / MEC - secretaria@cabbio.uy

Paraguai: CONACyT - ciencia@conacyt.org.py

Colômbia: COLCIENCIAS - contacto@colciencias.gov.co – deve-se obedecer a data-limite informada no site www.colciencias.gov.co.

PROCESSO DE SELEÇÃO PARA CANDIDATOS BRASILEIROS:

A seleção de candidatos será realizada pela comissão coordenadora do curso, e homologada pela diretoria do CBAB, seguindo as instruções em:
http://www.mct.gov.br/index.php/content/view/328350/Instrucoes_para_candidatos_brasileiros.html

PROCESSO DE SELEÇÃO PARA CANDIDATOS ESTRANGEIROS: seguindo as instruções em:
http://www.mct.gov.br/index.php/content/view/328347/Candidatos_argentinos_uruguaios_paraguaios_e_colombianos.html


APÓS A HOMOLOGAÇÃO DO PROCESSO DE SELEÇÃO, OS CANDIDATOS SERÃO CLASSIFICADOS EM:

ALUNOS COM CUSTEIO: 16 ( 7 alunos brasileiros, 4 alunos argentinos, 3 alunos do Uruguai, 1 aluno paraguaio e 1 aluno da Colômbia)

ALUNOS SEM CUSTEIO SOMENTE PARA BRASILEIROS: 14. (TAXA DE MATRÍCULA: R$150,00, NÃO INCLUINDO ALIMENTAÇÃO NEM HOSPEDAGEM)

Local:
LNCC - Laboratório Nacional de Computação Ciêntifica

Endereço:
Getúlio Vargas Av., 333, Quitandinha
Petrópolis - Rio de Janeiro
CEP 25651-075 - Brasil

Telefone:
(24) 2233.6004

Data Início: 27/07/2015
Data Fim: 07/08/2015

Contato:
Marisa Fabiana Nicolas - marisa@lncc.br

Conferencista:
Alinne Castro - - UCDB
Antonio Mauro Rezende - Fiocruz/CPqAM -
Daniel Guariz Pinheiro - - USP
Elmer A Fernandez - Universidade de Córdoba -
Guilherme Loss de Morais - - LNCC
José Miguel Ortega - Universidade Federal de Minas Gerais - UFMG
Marisa Fabiana Nicolás - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Maurício Egidio Cantão - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Embrapa Suínos e Aves - EMBRAPA
Milene Ferro - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho -
Pablo Ivan Ramos - Fundação Oswaldo Cruz - Fiocruz-Bahia
Pedro A. F. Galante - Centro de Oncologia Molecular - Hospital Sírio-Libanês -
Rafael L M Guedes - - LNCC
Raphael Parmigiani - Hospital Sírio-Libanês -
Ricardo Henrique Kruger - Universidade de Brasília - UNB
Rita Maria Cunha de Almeida - Universidade Federal do rio Grande do Sul, Instituto de Física - UFRGS
Roney Santos Coimbra - FIOCRUZ / BH - FIOCRUZ/ BH

Convidado:
Maurício Egidio Cantão - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Embrapa Suínos e Aves - EMBRAPA

Professor:
Daniel Guariz Pinheiro - - USP
Gabriel da Rocha Fernandes - FIOCRUZ Minas -
Maurício Egidio Cantão - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Embrapa Suínos e Aves - EMBRAPA
Pablo Ivan Ramos - Fundação Oswaldo Cruz - Fiocruz-Bahia
Pedro A. F. Galante - Centro de Oncologia Molecular - Hospital Sírio-Libanês -
Roney Santos Coimbra - FIOCRUZ / BH - FIOCRUZ/ BH

Secretaria:
Marisa Fabiana Nicolas - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC


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